1953 году образован курс организации фармацевтического дела с кафедрой Фармакогнозии. В 1964 году курс стал самостоятельной кафедрой организации фармацевтического дела с курсом медицинского товароведения.

В 1964-1970 гг. кафедру возглавлял заместитель начальника Главного аптечного управления МЗ КазССР Гольдман М.М., отличник здравоохранения СССР. В период с середины 70-х по 90-е годы большой вклад в организацию работы кафедры внесли преподаватели к.фарм.н., доцент Нурахов Д.Б., к.фарм.н., доцент Радюк М.И., к.фарм.н., доцент Шопабаева А.Р., к.фарм.н., доцент. Дюсембинова Г.А, к.фарм.н. преподаватели: Бимурзаев А.А., Алиханова Р.И., Никонова Л.П., преподаватели – Бучнева В.С., Нускабаев Б.Д., Потапова Т.И. и другие.

В 1970-1977 гг. кафедрой заведовал д.фарм.н., профессор К.У. Ушбаев, одновременно работавший начальником КазГАПУ МЗ КазССР. С 1978-1987 гг. кафедру возглавлял доцент Иктисамов Ш.А. В 1987-1991 гг. заведующим кафедрой был доцент Нурахов Д.Б. В 1991-1997 гг. кафедру возглавляла д.фарм.н., профессор Оконенко Л.Б. В 1997-2003 гг. кафедру организации и экономики фармации объединили с кафедрой технологии лекарственных форм, которой заведовал д.биол.н., профессор Абдуллин К.А. С 2003 г. по 2007 г. кафедрой заведовал к.фарм.н., доцент Датхаев У.М. С 5 февраля 2007 года кафедру возглавлял д.фарм.н., профессор Байзолданов Т.Б. С марта 2011 года кафедрой заведовал д.фарм.н., профессор Дильбарханов Р.Д.

Кафедра реорганизована и названа модуль «Фармацевт — менеджер». С сентября 2011 года модулем «Фармацевт — менеджер» руководила к.фарм.н., профессор Шопабаева А.Р.

Кафедра фармацевтических дисциплин с курсами — управления и экономики фармации и клинической фармации, фармацевтической химии, фармакогнозии, химико-токсикологических дисциплин была организована 1 сентября 2016 года, согласно приказа КазНМУ им. С.Д.Асфендиярова за № 5461 л/с от 21.09.2016г. «О создании и закреплении структурных подразделений университета». Заведующим кафедры был назначен д.фарм.н., профессор Датхаев У.М.

Кафедра организации, управления и экономики фармации и клинической фармации организована 1 сентября 2017 года, согласно приказа КазНМУ им. С.Д.Асфендиярова за № 496 от 12.09.2017г. «О создании и закреплении структурных подразделений университета».

В настоящее время заведующим кафедрой является д.PhD, доцент Жакипбеков К.С.